很多恐龍的軀體上都覆蓋著鱗片，鱗片的作用很大。皮膚上沒有鱗片的甲龍，就無法抵禦敵人的攻擊。鱗片緊密的排列，在關節連接處漸漸小下去，這樣身體才能活動自如。鸚鵡龍全身都佈滿了鱗片。優甲龍的頭與肩部之間的皮膚上，長有前端尖尖的刺或圓圓的瘤狀物。
犬顎龍的全身上下長滿了長短不齊的毛，臉上也長有像狗和貓一樣的鬍鬚。還有些恐龍身上長有刺，比如劍龍，背上和尾巴上的尖刺成對分佈，連大腿上也有一對尖刺。孽子龍腰側的尖刺也是成對分佈，不過這些刺是橫向生長的。
恐龍的肌肉都比較強健，尤其是刺盾角龍，角周圍的肌肉凹凸不平，非常發達。
不同恐龍的頭骨相差很大。似蜥龍的頭骨小而輕，使牠可以不費力地轉動腦袋。鵝冠龍的頭部只有一塊大骨片，非常結實，像一個頭盔一樣保護著頭部。冠額龍的頭骨是二塊小而薄的骨板。
石頭龍的頭骨就真像石頭一樣，強而有力，當石頭龍的頭部受到猛烈撞擊的時候，頭骨可以消除一部分撞擊力，保護頭部不受傷害。原頭龍也有渾厚的頭骨，頭骨厚度達25公分，是人類的30多倍，可是牠的腦容量卻很小。鴨冠龍有像鴨嘴一樣的顎骨，扁而平的顎骨長在牠的頭部
。恐龍的頸部也有骨板。劍龍的頸和尾部之間，有一對對整齊排列的三角形骨板；馬門溪龍長達10公尺的脖子，就是由19塊強韌的骨頭支撐而成的。梁龍的背骨很長，從肩部一直到腰部，支撐著頭、尾巴、腹部三個部分。梁龍的背骨是中空的，非常輕巧，背骨頂部有一個細小的突起，用來連接背部的肌肉。肋骨包圍著腹部，向下延伸，不但有支撐腹部的重量、協助固定背骨的作用，還能夠保護內臟。整體看來，梁龍的背骨就像現代的吊橋。吊橋兩邊的支柱是前腿和後腿，纜線就是連接前腿和後腿、支撐沈重身體的背骨。
動物的腦部都有一個控制動物成長的腦下垂體，體型越大的動物，腦下垂體越發達。恐龍的腦下垂體都比一般動物大，這是牠身軀龐大的理由之一。